Ikkunoiden käsittely
Blenderin käyttöliittymä on hyvin joustava. Ikkunoita voi jakaa ja yhdistellä vapaasti. Jokaiselle ikkunalle voi valita tyypin sekä näytetäänkö otsikko-rivi ylä- vai alareunassa vai ei ollenkaan.
Ikkunatyyppi (Window type)
Ikkunatyypin voi vaihtaa jokaisen ikkunan äärimmäisenä vasemmalla olevasta valikosta.

Ikkunoiden jakaminen/yhdistäminen
Ikkunan voi jakaa klikkaamalla oikealla ikkunan reunalla (kun kursori on kaksoisnuoli) ja valistemalla Split Area. Sen jälkeen näyttöön ilmestyy pysty- tai vaakaviiva jonka avulla jakokohdan voi määrittää klikkaamalla.

Yhdistäminen tapahtuu valitsemalla Join Areas, jolloin nuoli kysyy kumpaan suuntaa yhdistäminen tehdään.
Ikkuna-layoutit
Animaation tekemisessä tarvitaan erilaisia työkaluja kuin
mallintamisessa ja videoeditoinnissa toisenlaisia kuin skriptaamisessa. Siksi löydät Blenderin yläreunasta valikon, jossa on kohdat Animation, Model, Material, Sequence ja Scipting. Ne ovat ikkuna-layoutteja, jotka ovat hieman kuin Linux-käyttäjille tutut virtuaalityöpöydät. 
Pikänäppäin layoutista toiseen vaihtamiseen on Ctrl + nuoli vasempaan tai oikeaan. Valitsemalla ADD NEW voit luoda omia layoutteja.
Asetusten tallettaminen
File -> Save Default Settings tallettaa sen hetkisen Blenderin tilan, ei siis pelkästään asetuksia vaan myös geometrian!
Jos siis haluat aloittaa aina uuden mallin tekemisen siitä, että näytöllä on pallo niin tee pallo ja talleta se yllämainitulla tavalla. Kun nyt avaat Blenderin, ruudulla on pallo kuution sijaan.